Sau ba năm là CFO của Constantia Việt Nam, từ năm 2019, bà Nguyễn Phụng Trân được bổ nhiệm làm tổng giám đốc. Công ty này là thành viên của Constantia Flexibles, tập đoàn đa quốc gia có trụ sở tại Áo, chuyên cung cấp các giải pháp bao bì đa dạng cho các công ty dược phẩm và hàng tiêu dùng. Tại đây, bà Trân dẫn dắt doanh nghiệp tới các mục tiêu tăng trưởng doanh số và phát triển bền vững. Giai đoạn 2013–2016, bà Trân là phó giám đốc tài chính của đại học RMIT tại TP.HCM. Bà cũng có hơn 13 năm làm việc tại P&G, trong đó có ba năm tại P&G Indochina tại Bình Dương với vị trí giám đốc tài chính nhà máy, sau thời gian làm việc tại P&G Asia Singapore.
Bà Trân tốt nghiệp thạc sĩ Quản trị kinh doanh của trường Quản trị Eller thuộc ĐH Arizona (Hoa Kỳ) năm 2005 theo học bổng Fulbright. Bà có bằng cử nhân Quản lý Công nghiệp tại đại học Bách khoa TP.HCM.